第一，条施、穴施、集中施用(特别是生物有机肥和功能性有机肥)。从肥效上看，集中施用特别对发挥磷素养分的肥料最为有效。如果直接把磷素养分施入土壤，有机肥料中速效态磷成分易被土壤固定，因而其肥效降低。沟施、穴施的关健是把养分施在根系能够伸展的范围内。因此，集中施用时施肥位置是重要的，施肥位置应根据作物吸收肥料的变化情况而加以改变。最理想的施肥方法是，肥料不要接触种子或作物的根，距离根系有一定距离，作物生长一定程度后才能吸收利用。
第二，液体有机肥，含有大量速效养分，随灌溉施用，作追肥。有些腐熟好的有机肥料也可作追肥施用。但作追肥应注意以下事项：其一，有机肥中大量缓效养分释放需一过程，所以有机肥料做追肥时，同化肥相比追肥时期应提前几天。其二，有机肥料养分含量低，当有机肥料中缺乏某些成分时，可施用适当的单一化肥加以补充。其三，制定合理的基追肥分配比例。对高温栽培作物，最好减少基肥施用量，增加追肥施用量。 
第三，有机肥的养分供应另一原则是要满足有机肥提供的氮素。化肥提供的氮素=1：1需求。 
第四，不同质地土壤中有机肥料养分释放转化性能和土壤保肥性能不同，应采用不同的施肥方案。砂土应增施有机肥料，提高土壤有机质含量，改善土壤的理化性状，增强保肥保水性能。但对于养分含量高的优质有机肥料，一次使用量不能太多，使用过量也容易烧苗，转化的速效养分也容易流失，养分含量高的优质有机肥料可分底肥和追肥多次使用。也可深施大量堆腐秸秆和养分含量低、养分释放慢的粗杂有机肥料。粘土地施用的有机肥料必需充分腐熟；粘土养分供应慢，有机肥料应可早施，可接近作物根部。  白凝