黏孢子虫常引起鱼类发生种种严重的流行病，适宜在8～25℃的水温中繁殖蔓延，应重点加以预防。鱼类黏孢子虫病重在预防，首先要做好鱼池的清洁消毒工作：
　　1.用生石灰彻底清塘，每亩用生石灰125～150公斤，能消灭塘内的越冬孢子。
　　2.用石灰氮，每亩100公斤清塘，可杀灭越冬孢子。
　　3.在鱼种放养前，用500ppm的高锰酸钾，浸洗鱼种30分钟，能有效杀灭60%～70%的孢子。平时注意对渔场的渔具、用具定期用药物进行消毒，减少带入孢子传播的几率，对养殖场的产卵池、孵化池和鱼种池，要做到有独立的清洁干净的水源，杜绝引入带病原的水源感染鱼类发病。
　　4.用90%晶体敌百虫浸泡鱼种5分钟，再用敌百虫每立方米水体0.2克全池泼洒灭病。硫酸铜、硫酸亚铁挂袋法：用细密的布缝成小袋，把上述两种药物装入袋内，挂在鱼的食场周围水中。一般1亩以上鱼池，水深1米，可挂袋2个，每袋装硫酸铜100克，硫酸亚铁40克，连挂3天，每天换药1次，如果挂袋后鱼不来吃食，说明药液太浓，可酌量减少。本法用于防治寄生虫鱼病效果好。